Mots-Clés

Extraction de connaissances, découverte de sous-groupes, données liées, graphes de connaissances

Description

Dans le cadre du projet CombO en lien avec le Health Data Hub et le Centre Léon Bérard (CLB) de Lyon, nous cherchons un⸱e postdoc pour un contrat de 2 ans. 

Le⸱a postdoc fera parti⸱e de l’équipe HeKA (Inria, Inserm, Univ. Paris Cité, https://team.inria.fr/heka/fr/) et sera localisé⸱e à Paris, in PariSanté Campus (https://parisantecampus.fr/, https://goo.gl/maps/eW55zuHd2ggt2Q4Z9).

Des déplacements réguliers au CLB de Lyon sont à prévoir (frais pris en charge).

Le postdoc sera employé par Inria Paris et suivra pour cette raison la grille de salaire Inria.

Le projet de recherche du postdoc concerne l’extraction de connaissances à partir de données de santé, et plus particulièrement la recherche de sous-groupes de patients qui répondent de façon homogène aux combinaisons de chimiothérapie.

La mission du postdoc débutera par une phase de préparation de données, incluant l’extraction de marqueurs de réponse et de descripteurs à partir des notes cliniques de dossiers patients informatisés, la liaison de données cliniques et génétiques des patients avec les graphes de connaissances et ontologies de domaines. 

Il s’agit ensuite d’explorer les méthodes de découverte de sous-groupes afin de mettre en évidence des ensembles de patients répondant différemment aux différentes combinaisons de molécules chimiothérapiques.

Compétences appréciées : 

Extraction de connaissances, fouille de texte, approches non-supervisées, découverte de sous-groupes, données de santé, graphes de connaissances

Python, spaCy, RDF, Sparql