Ingénieur(e) Bio-informatique
CDD · IE · 12 mois (renouvelable) Bac+5 / Master Institut FRançais de la Vigne et du Vin · Colmar (France) - Salaire d’ingénieur selon l’expérience
Date de prise de poste : 1 février 2023
Mots-Clés
données transcriptomiques design de pipelines PGD LINUX
Description
Dans le cadre du développement de ses activités liées au séquençage haut-débit (HTS), l’IFV pôle Alsace-Grand Est recrute un(e) ingénieur(e) bio-informatique, basé(e) sur Colmar dans les locaux de l’INRAE. La personne recrutée aura la responsabilité d’analyser des données de transcriptomiques, principalement pour obtenir des informations sur le virome de la vigne. La personne travaillera en étroite interaction avec l’équipe de virologie et de génomique de la vigne de l’IFV/INRAE.
Missions :
- Design, développement et maintenance (versioning) de méthodes d’analyse et pipelines bio-informatiques dans un environnement Linux
- Comparaison des outils open-source (ligne de commande) vs un logiciel payant sous forme d’interface graphique, actuellement utilisé en routine
- Mise en place et application d’un plan de gestion de données
- Validation de la qualité des données et de l’intégrité des fichiers, traçabilité et sauvegarde des fichiers.
Profil recherché :
- Bac +5 (ou expérience équivalente) en bio-informatique
- Expérience sur des traitements de données de séquençage haut-débit
- Bonne connaissance de l’environnement LINUX
- Maitrise d’au moins un langage de programmation de haut niveau (bash, R, Python …)
- Connaissances de base de l’anglais scientifique pour une recherche bibliographique efficiente
Contrat
- CDD d’1 an sur projet PNDV avec possibilité de poursuite
- Poste à pourvoir début d’année 2023
- Salaire d’ingénieur selon l’expérience
Candidature
Procédure : Envoyez votre CV et lettre de motivation par email à Jean-Michel Hily avec en objet ‘IFV-Bioinfo_Prenom_Nom’ : jean-michel.hily@vignevin.com
Date limite : 6 janvier 2023
Contacts
Jean-Michel Hily
jeNOSPAMan-michel.hily@vignevin.com
Offre publiée le 24 novembre 2022, affichage jusqu'au 6 janvier 2023