Mots-Clés
métagénomique
pipeline
startup
Description
1 Qui sommes nous ?
Dans le monde de la recherche, les technologies de séquençage ne cessent d’évoluer et de générer de plus en plus de big data. Cette évolution entraîne une augmentation des demandes d’analyses génomiques et plus particulièrement dans le domaine de la métagénomique, encore trop délaissés par rapport à la génomique humaine.
C’est dans ce contexte que deux ingénieurs en bioinformatique ont créé la startup Biogenosis et ont développé leur premier outil : Biogenosis Visual. Cette solution permet à tous chercheurs initiés ou non à la bioinformatique de pouvoir analyser leurs données. La première version de Biogenosis Visual s’est focalisée sur l’exploration WGS. Les futurs développements se tournent vers de l’analyse métagénomique, c’est pourquoi nous recherchons un(e) ingénieur(e) en bioinformatique.
Pour en savoir plus sur Biogenosis : https ://biogenosis-bioinfo.com/
2 Missions et activités principales
L’ingénieur(e) en bioinformatique sera en charge du développement d’un pipeline d’identification et d’analyses sur de la métagénomique shotgun.
L’objectif sera d’automatiser les scripts d’analyses développés via un gestionnaire de workflow, de générer sous un rendu graphique et un rapport les résultats d’analyses. De plus, l’ingénieur(e) bioinformatique continuera d’améliorer les autres pipelines d’analyses métagénomiques déjà présents.
3 Compétences
• Avoir des compétences en statistiques et génomique
• Maîtrise des langages de programmation Python et R
• Maîtrise d’un gestionnaire de workflow (Nextflow)
• Savoir interagir avec des personnes ayant des horizons et intérêts variés (biologie, bioinformatique...)
• Être autonome et savoir travailler en équipe
• Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine de compétence
4 Atouts du poste
• Travail dans un environnement startup
• Accessibilité : transports en commun à proximité, parking vélos sécurisé
• Prise en charge de l’abonnement transport en commun à 50%