Mots-Clés

Bio-informaticien

Description

MISSION

Au sein de la Plateforme de Génétique Moléculaire et de l’Unité Omiques et Data Science, le bio-informaticien est chargé de la mise en place, du maintien et de l’amélioration des workflows d’analyse bioinformatique provenant des séquenceurs à haut débit (NGS) à visée diagnostique et recherche, et de l’analyse des données de génomique (WES, WGS). Il participe à l’accréditation ISO15189 des applications bioinformatiques.

PRINCIPALES ACTIVITÉS

Bioinformatique

• Mise en place et supervision des workflows d’analyses bioinformatiques basés sur les techniques de biologie moléculaire et technologies de séquençage nouvelle génération présentes sur la Plateforme de Génétique Moléculaire et du Département de Biologie médicale pour les criblages du génome, du transcriptome et des éléments de régulations génomiques.
• Participation à l’exécution des workflows d’analyses bioinformatiques utilisés dans le cadre de l’activité diagnostique du Département de Biologie Médicale et du maintien de la continuité des soins, et de l’activité de recherche utilisant des données de génomique, tel le(s) projet(s) EPICURE.
• Analyse des données de séquençage à haut débit (NGS) de l’exome (WES) et du génome (WGS) produites sur la plateforme de l’ICO : synthèse des résultats, signatures mutationnelles, CNA, phylogénétique tumorale…
• Mise en forme des résultats (visualisation des données).
• Formation des utilisateurs finaux.
• Participation aux évolutions techniques et applicatives des workflows mis en place.
• Veille scientifique.

Qualité

• Mise en place et maintien de l’accréditation ISO15189 du séquençage nouvelle génération pour la composante informatique en relation avec le responsable de l’accréditation.
• Participation au système de management de la qualité via l’extraction de données du logiciel de gestion de laboratoire (activité, facturation, délais, non-conformités …).

Projets

• Gestion de projets transversaux de la Plateforme de Génétique Moléculaire liés aux soins et à la recherche.

Autres

• Participation à la valorisation scientifique de la Plateforme de Génétique Moléculaire et de l’Unité Omiques et Data Science (articles, posters, communications orales…).
• Encadrement de stagiaires de la Plateforme de Génétique Moléculaire et de l’Unité Omiques et Data Science (M1, M2).

DIPLOMES ET COMPÉTENCES REQUISES

• Diplôme : Bio-informaticien (BAC +5)
• Double formation universitaire : Biologie (biologie moléculaire et génomique) et Informatique (langages : Python, R, HTML, SQL … ; environnement : Unix) : requis
• Connaissance de la norme ISO15189 et de la démarche qualité au sein de l’établissement souhaité

CONTRAT-STATUT

• Date de la mission : dès que possible
• Type de contrat : CDI 100 %
• Site : Angers
• Rémunération : Selon expérience

CONTACT

Merci d’adresser votre candidature, au plus tôt, à
La Direction des Ressources Humaines – INSTITUT CANCEROLOGIE DE L’OUEST
par mail : srh.recrutement@ico.unicancer.fr