Mots-Clés
Biologie moléculaire, Analyses NGS, Statistiques, Génomique
Description
Je suis l'occupant actuel du poste et je suis bientôt en fin de contrat. Pour tous renseignments supplémentaires vous pouvez me contacter par mail: lambard.alexandre@gmail.com ou sur linkedin https://www.linkedin.com/in/alexandre-lambard-5b64221bb/
Mission de VSC en biologie moléculaire (H/F)
Référence du poste : VSC 2023-1262
Structure d'accueil : Département des Ressources Biologiques et Environnement
Unité de recherche Lagons, Ecosystèmeset Aquaculture Durable en Nouvelle Calédonie
Localisation : Taiarapu-Ouest, Îles du Vent, PF
Durée du contrat : 12 mois renouvelable une fois
Date de clôture de réception de candidatures : 13/03/2023
Description de l'offre:
L’unité « Ressources Marines en Polynésie Française » (RMPF), intégrée au sein de l’UMR 241 « Ecosystèmes Insulaires Océaniens » (EIO) développe des recherches en appui au développement durable des filières aquacoles en Polynésie française. Au-delà de cette approche appliquée, RMPF développe ses recherches dans un cadre écosystémique visant à une meilleure compréhension des systèmes lagonaires exploités en y intégrant les aspects environnementaux tant pour une meilleure connaissance de la physiologie des animaux et des processus écologiques que pour la prise en compte des impacts anthropiques aux différentes échelles. RMPF est membre du Labex CORAIL.
Au sein de l'unité de recherche Ressources Marines en Polynésie Française (RMPF), vous participez en collaboration avec les partenaires institutionnels (Direction de Ressources Marines, Université de Polynésie Française) et du secteur privé, aux travaux de recherche inscrits dans le cadre des conventions de recherche en diversification et suivi environnemental (financés par le Territoire et le secteur privé), chez les espèces d’intérêt du laboratoire RMPF (holothurie, platax, huitre de roche, huitre perlière).
De formation master +2 ou ingénieur, vous aurez pour mission de développer des approches de génomique environnementale sur du matériel biologique issu d’échantillonnages en milieu naturel ou d’approches expérimentales auxquels vous contribuerez.
Vous contribuerez aux extractions (ADN/ARN), à la construction de banque pour séquençage NGS et aux analyses de diversité génétique, richesses spécifique et/ou d’expression différentielle de gènes.
L'ensemble de ces travaux s'inscrit dans le cadre de projets financés au travers : 1) de conventions de recherche en aquaculture avec la Polynésie Française 2) de projets de recherche ANR 3) de projets Ifremer Politique de Site et 4) des conventions avec le secteur privé. Ces projets sont menés en étroite collaboration avec la Direction des Ressources Marines, le secteur privé et les institutions (UMR EIO & CRIOBE).
Profil recherché
Formation initiale :
- Master II / Ingénieur
- Une expérience en laboratoire de recherche est fortement souhaitée
Compétences techniques / métiers
- Biologie moléculaire (génomique environnementale)
- Analyses NGS ( transcriptomiques et/ou metabarcoding sur cluster de calcul et/ou génétique des populations) sur des espèces non modèles
- Développement de pipelines d’analyse à déployer en routine
- Encadrement et support bio-informatique, programme Bash et Python
- Connaissances en génétique quantitative seraient un plus
- Veille technologique et scientifique
- Statistiques appliquées à la génomique
- Aptitude à la rédaction (rapports et articles scientifiques)
- Maîtrise de l'anglais scientifique.
Qualités personnelles
- Sens de l’organisation, rigueur, esprit d’initiative, grande polyvalence, dynamisme.
- Sens du contact, aptitude à communiquer et travailler en équipe.
- Intérêt pour le monde économique et social.
- Maîtrise des outils informatiques et statistique
- Permis B souhaité.
Conditions de travail
- Temps complet : 100%
- Le statut du volontariat de service civique est régi par la réglementation relative au service civique. Montant de l’indemnité : 2.000 €uros mensuels brut (exonérée de l’impôt sur le revenu)
L’Ifremer
Reconnu dans le monde entier comme l’un des tout premiers instituts en sciences et technologies marines, l’Ifremer s’inscrit dans une double perspective de développement durable et de science ouverte. Il mène des recherches, innove, produit des expertises pour protéger et restaurer l’océan, exploiter ses ressources de manière responsable, et partager les connaissances et les données marines afin de créer de nouvelles opportunités pour une croissance économique respectueuse du milieu marin.
Présents sur toutes les façades maritimes de l’hexagone et des outremers, ses laboratoires sont implantés sur une vingtaine de sites dans les trois grands océans : l’océan Indien, l’Atlantique et le Pacifique. Pour le compte de l’Etat, il opère la Flotte océanographique française au bénéfice de la communauté scientifique nationale. Il conçoit ses propres engins et équipements de pointe pour explorer et observer l’océan, du littoral au grand large et des abysses à l’interface avec l’atmosphère.
Ouverts sur la communauté scientifique internationale, ses 1500 chercheurs, ingénieurs et techniciens font progresser les connaissances sur l’une des dernières frontières inexplorées de notre planète ; ils contribuent à éclairer les politiques publiques et à l’innovation pour une économie bleue durable. Leur mission consiste aussi à sensibiliser le grand public aux enjeux maritimes.
Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), dont le budget avoisine 240 millions d’Euros. Il est placé sous la tutelle conjointe des ministères de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation (MESRI), de la Mer (MinMer), de la Transition écologique et solidaire (MTES), de l’Agriculture et de l’Alimentation (MAA).
Pour postuler
Date de clôture de réception de candidatures : 13/03/2023
Toutes nos candidatures sont traitées exclusivement via notre site Carrières.