Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

Bio-informatique clinique transversal hôpital soin IA big data

Description

PRESENTATION & MISSIONS
L'Hôpital Saint-Louis est un hôpital universitaire public situé à Paris, en France. Il fait partie du Groupe Hospitalier Universitaire APHP
Nord. Il propose près de 700 lits et places et compte environ 3 500 personnels paramédicaux. L'hôpital se trouve près du canal Saint-
Martin, dans un quartier dynamique, et est au cœur d'un patrimoine historique exceptionnel.L’hôpital Saint-Louis possède un plateau
technique de biologie avec une forte valence de recherche clinique, un grand potentiel dans les techniques « omiques » et abrite plusieurs
centres nationaux de référence et de laboratoires de biologie médicale de référence.L’hôpital Saint-Louis détient aussi des labellisations
pour 17 centres de référence et de compétence maladies rares regroupés au sein de la Plateforme d’expertise maladies rares Paris Nord.
En tant que centre d'innovation et de recherche, l'hôpital Saint-Louis inclut sur son campus plusieurs unités de recherche INSERM/CNR
regroupées au niveau de l’institut de recherche Saint-Louis (IRSL), doté d’une plateforme incluant des pôles de cytométrie, d’Imagerie,
de génomique et un BioDataCenter.
En tant que bioinformaticien.ne, vous rejoindrez la Cellule Bioinformatique de l'Hôpital Saint-Louis, composée de 4 bioinformaticiens.
Cette cellule bénéficie d’une animation encadrée par 2 biologistes médicaux incluant des séances de travail communes avec tous les
bioinformaticiens et des fils de discussion Slack. Cette équipe vous permettra de partager vos connaissances et d'obtenir de nouvelles
idées pour améliorer les projets en collaboration avec d'autres professionnels de la bioinformatique spécialisés dans divers domaines.
CONTACTS PROFESSIONNELS :
Le bioinformaticien.ne de recherche clinique interagit avec un comité de pilotage pour la sélection des projets de recherche retenus
pour des analyses bio-informatiques. Une fois les dossiers retenus, il travaille directement avec les porteurs de projet des équipes
cliniques et biologiques.
ACTIVITES :
• Travailler en étroite collaboration avec les équipes cliniques
• Définir les objectifs et les méthodologies des projets de recherche impliquant une analyse bio-informatique.
• Analyser les données obtenues via les différents projets cliniques transversaux
• Présenter et synthétiser les résultats obtenus
• Si affinité,
- Développer et mettre en œuvre des algorithmes d'IA adaptés aux données cliniques et biologiques.
- Proposer de nouvelles méthodes d'analyse de données utilisant l'IA et les technologies du big data.
VOTRE MISSION :
Le ou la bioinformaticien.ne recruté.e contribuera au développement de projets de recherche clinique pour améliorer le diagnostic, le pronostic et le choix des stratégies thérapeutiques.
PROFIL DU CANDIDAT :
Bac+5 minimum (master 2)
• Connaissance de l’environnement Linux
• Maitrise des outils de programmation (Python ou R, éventuellement C++)
• Maitrise de Frameworks et d’outils d’Intelligence Artificielle (TensorFlow, Keras, PyTorch, ou autre)
• Analyse des données de séquençage haut débit
• Capacité à identifier et prioriser les besoins, axes de recherche et les challenges dans une équipe interdisciplinaire
• Capacité à travailler au sein d’équipes pluridisciplinaires
• Curiosité intellectuelle
• Esprit de synthèse
• Prise de parole en public
Langues :
• Bonne connaissance du français oral et écrit
• Compréhension de l’anglais oral et écrit
CE QUE L’ON VOUS PROPOSE
• Rémunération entre 2 000€ et 2 200 € nette en fonction de l'ancienneté.
• Temps complet, CDD de 12 mois renouvelable
LES AVANTAGES À NOUS REJOINDRE
-Notre hôpital dispose d'une crèche dans l’enceinte de l’établissement. Elle accueille les enfants jusqu’à 3 ans 1/2.
L’attribution des places se fait par les commissions de crèche qui ont lieu 4 fois par an en mars, juin, septembre et
décembre.
- Remboursement de la moitié du Pass Navigo
- Médiathèque et service social dédié au personnel
- Un comité d’entreprise en charge de l’action sociale, culturelle, sportive et des loisirs. (AGOSPAP