Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

java software development metabolomics semantic web

Description

JAVA software development engineer - FAIR e-resource management software tools

L’ingénieur.e recruté.e travaillera dans le groupe de travail « création de ressources FAIR pour l’exploration des connaissances » du projet MetaboHUB afin de mettre à disposition un catalogue des données disponibles au sein du consortium.

L’objectif de ce travail est de piloter et d’interroger des graphes de données consultables sur le lac de données du projet, dédié aux activités de recherche sur les graphes de connaissance en métabolomique et à la gestion des données massives d’acquisition d’appareillage des plateformes du consortium MetaboHUB. L'ingénieur.e devra développer plusieurs composants pour satisfaire toutes les fonctionnalités. Ces développements devront alimenter le lac de données avec des données provenant de bases de connaissances externes (fournisseurs de données de référence en bioinformatique) et intégrer les données et méta-données des plateformes du consortium. Le développement intégrera un composant de consultation pour les utilisateurs du consortium accessible via un portail web et une API (interface de programmation et d'interrogation) pour alimenter les systèmes d'information du consortium.