Mots-Clés
Alternance, bioinformatique
Description
Poste ouvert en contrat d’apprentissage pour 12 mois
Diplôme préparé : Master 1 ou 2 en bio-informatique/biostatistique
Niveau requis bac + 3 ou Bac + 4
- La structure que vous allez rejoindre
L’Institut Méditerranéen d’Océanologie (MIO, Marseille), fait partie de l'Institut OSU-Pythéas et est sous la direction conjointe de l'Université Aix-Marseille, de l'Université de Toulon, du CNRS et de l'IRD. Son objectif est de mieux comprendre le système océanique et son évolution en réponse au changement global. Le MIO constitue ainsi un centre d'expertise en biologie marine, écologie, biodiversité, microbiologie, halieutique, physique, chimie, biogéochimie et sédimentologie.
Votre mission s’inscrira dans le cadre des activités bio-informatique de la plateforme OMICS (resp. F. Armougom & L. Casalot) du MIO, labellisée plateforme technologique AMU et certifiée ISO9001v2015. Les activités auxquelles vous participerez concerneront la caractérisation taxonomique et fonctionnelle de la biodiversité des écosystèmes marins par des approches de séquençage haut débit (e.g. metabarcoding, metagenomique). Par votre intégration au sein de la plateforme OMICS et notre accompagnement dans i) la mise en place de pipelines, ii) l’analyse de données haut débit et iii) la rédaction de rapports, vous aborderez sereinement la poursuite de votre cursus ou vos futures recherches d’emploi dans ce secteur.
Au sein du MIO, vous intégrerez l'équipe de Microbiologie Environnementale & Biotechnologie (MEB) dont l’objectif est de comprendre le rôle et le fonctionnement du compartiment microbien dans les écosystèmes marins naturels, affectés par des perturbations anthropiques ou encore induites par le changement climatique.
- Le profil que nous recherchons
En formation universitaire en bio-informatique/biostatistique, vous possédez des connaissances dans le domaine de la microbiologie et le séquençage haut débit. Les compétences souhaitées, ou en cours d’apprentissage, ciblent l’analyse de données de séquençage haut débit (e.g. Miseq, Oxford Nanopore), la biostatistique, un langage de programmation (e.g. Python, Shell), la génomique comparative ou encore l’assemblage et l’annotation de génomes. Vous devrez faire preuve de rigueur, d’une bonne capacité d’écoute et d’un bon relationnel pour interagir avec les membres de l’équipe.
- L’IRD, un Institut qui donne du sens à votre carrière
Votre mission au service d’une science engagée pour un futur durable : L’IRD en 230 secondes