Chargé(e) d’études bio-statistiques
CDD · IE · 24 mois (renouvelable) Bac+5 / Master Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases, Imagine Institute, INSERM U1163 · paris (France) selon grille et ancienneté
Date de prise de poste : 4 septembre 2023
Mots-Clés
épidémiologie, biostatistiques, informatique biomédicale, génétique humaine
Description
Mission principale :
Le projet de Recherche Hospitalo-Universitaire en santé (RHU5) COVIFERON, porté par le Pr. Jean-Laurent Casanova, vise à déchiffrer les bases génétiques et immunologiques des différentes formes de COVID-19, à développer des tests de détection des auto-anticorps anti interférons de type I (IFN-I), et à proposer des nouvelles alternatives thérapeutiques contre la COVID-19. Dans le cadre de ce projet, nous recherchons un(e) Data Manager / Chargé(e) d’études statistiques. Le poste à pourvoir est basé dans le laboratoire de Génétique Humaine des Maladies Infectieuses, à l’Institut Imagine, à Paris.
Les missions principales du Data Manager seront d’assurer l’administration et le contrôle qualité de la base de données biomédicales centralisée (créée sous REDCap®), et de croiser les données de la base avec les données génétiques des patients (séquençage haut débit) afin de réaliser des analyses d’association génétique standardisées.
Activités :
- Administration de la base de données centralisée :
- Maintenance et gestion de la base de données sous REDCap®, optimisation de la structure ou du fonctionnement de cette base au cours du projet
- Contrôle qualité des données recueillies (contrôles systématiques de cohérences, création de rapports automatiques pour correction, nettoyage de la base, etc.)
- Rédaction des procédures de gestion et de contrôle qualité des données et de traçabilité des modifications sur les données, du dictionnaire des variables et autres documentations nécessaires au projet
- Préparation d’extraction de données en vue d’analyses statistiques
- Participation à la rédaction des différents rapports d’avancement du projet (investigateurs, financeur, coordinateur, promoteur) : reporting des inclusions et suivi, description de l’état d’avancement du data management, cohérence et complétion des données, description de la population d’étude
- Participation à la gestion des aspects réglementaires
- Analyses d’association génétique :
- Analyses descriptives détaillées des données cliniques
- Croisement des données de la base biomédicale avec les données génétiques disponibles (séquençage de l’exome ou du génome)
- Etude d’association entre les variants génétiques et les différents phénotypes cliniques en lien avec l’infection par le SARS-CoV-2
Savoir-faire requis et connaissances associées :
Compétences professionnelles requises :
- Maitrise des principes de gestion de bases de données
- Expérience d’utilisation du logiciel REDCap® appréciée
- Connaissances en biostatistiques et en épidémiologie
- Bases en génétique humaine très appréciées
- Connaissance du langage R
- Connaissance de l’environnement linux
- Lire des scripts shell et comprendre leur fonctionnement
- Maîtrise de l’outil informatique (Word, Excel, power point)
- Aptitude à travailler en équipe, à s’adapter aux contraintes
- Confidentialité : le data manager est soumis au secret professionnel dans le cadre des données qu’il aura à gérer
- Sens de l’organisation, rigueur et respect des délais
- Bonnes capacités rédactionnelles
- Maîtrise de la langue anglaise
Qualités requises :
- Éthique et déontologie médicales
- Qualités relationnelles et goût pour le travail en équipe
- Dynamisme et mobilité
- Rigueur, méthode et aptitude à la gestion des priorités
- Sens de l’initiative
- Discrétion et respect de la confidentialité
Expérience et contexte
- Bac +5 (Master) spécialisé en épidémiologie, biostatistiques, informatique biomédicale ou discipline apparentée
Candidature
Procédure : Envoyer un email à aurelie.cobat@inserm.fr et laurent.abel@inserm.fr
Date limite : 31 août 2023
Contacts
Laboratoire de Génétique Humaine des Maladies Infectieuses, Institut Imagine
auNOSPAMrelie.cobat@inserm.fr
Offre publiée le 31 mai 2023, affichage jusqu'au 31 août 2023