Mots-Clés
Bio-informatique
NGS
Description
PathoQuest est une société spécialisée de prestation de service (CRO), spin off de l’Institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le Contrôle Qualité des produits pharmaceutiques d’origine biologique. PathoQuest propose aux Biotech innovantes du monde entier un service expert complet de la réception des échantillons à la production des certificats d’analyse. Ses tests utilisent des protocoles propriétaires de traitement des échantillons, une plateforme de séquençage NGS (Next Generation Sequencing) et des pipelines d’analyses bio-informatiques spécialisés. Actuellement en phase de scale-up, nous comptons une cinquantaine de collaborateurs en France et aux Etats-Unis.
Nous recherchons actuellement un Ingénieur Bio-informatique h/f au sein de notre département Opérations.
Votre mission
Au sein du département Opérations, sous la responsabilité du Head of Bioinformatics, vous assurez le suivi, l'exécution et le rendu dans les délais des analyses bio-informatiques des données produites par les plates-formes de séquençage de la société, principalement celles qui concernent les prestations de sécurité virale et de caractérisation génétique.
- Participer aux activités de production de l’entreprise et à leurs évolutions
- Réaliser les analyses clients internes et externes
- Suivre la démarche qualité de l’entreprise lors des phases de conception, de développement et de déploiement des produits logiciels bio-informatiques, notamment en rédigeant les documents associés (spécifications fonctionnelles, cahier de tests)
- Assurer une veille technologique efficace en bio-informatique
- Participer à l’assurance qualité des produits selon le référentiel des Bonnes pratiques de Fabrication (BPF)
Profil
De formation en bio-informatique, vous avez une expérience sur une fonction similaire sur Illumina ou Nanopore.
Vous maîtrisez les langages de développement bio-informatique tels que Python et R.
Vous êtes à l’aise de travailler dans un environnement Linux et sur des serveurs de calcul haute performance.
Vous savez analyser des données de séquençage haut-débit et en interpréter les résultats.
Compétences techniques : Assemblage De Novo & Guidé, Mapping, Linux, NCBI, NGS, Blast.
Connaissance en biologie (biologie moléculaire et cellulaire, génomique et génétique).
Connaissance des normes qualité de type BPF.
Un bon niveau d’anglais est un plus.
- Capacité à travailler en équipe et à l’interface entre plusieurs disciplines
- Excellente rigueur dans le suivi des processus
- Curiosité et intérêt pour des domaines en forte évolution
- Qualités relationnelles et faculté d’adaptation
- Autonomie et sens de l’initiative
Localisation
- Ce poste est basé près du bureau de Paris (13e arrondissement) en France.
Rémunération
- En fonction de l’expérience du candidat
Les avantages du projet
- Environnement en pleine croissance, start-up dynamique, innovante et ambitieuse
- Une entreprise à la pointe de la génétique, de la bio-informatique et de la biologie moléculaire
- Portefeuille de clients attrayant et d'envergure mondiale