Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

Bioinformatique NGS Biologie Moléculaire Génomique

Description

PRESENTATION GENERALE DU SECTEUR D’ACTIVITE

Les laboratoires de génomique humaine au sein du  Plateau de Biologie et Médecine Moléculaire (PBMM) du CHU d’Angers sont constitués :

• D’une UF de Génétique moléculaire au sein du service de Génétique réalisant le diagnostic pré- et post-natal de pathologies héréditaires. Son activité est principalement centrée sur les pathologies suivantes : maladies mitochondriales, neurogénétique, mucoviscidose, myopathies, hémochromatose, maladie de Huntington, sclérose tubéreuse de Bourneville, maladie de Charcot Marie Tooth, anomalies de la réceptivité hormonale et oncogénétique somatique et constitutionnelle.

• D’une UF de Cytogénomique au sein du service de Génétique  réalisant le diagnostic réalisant le diagnostic pré- et post-natal de pathologies chromosomiques et génomiques.

• D’une UF de biologie moléculaire au sein du service de biochimie. Son activité est principalement centrée sur les pathologies suivantes : maladies mitochondriales, réceptivité hormonale, oncogénétique.

LIEU D’EXERCICE

Plateau de Biologie et Médecine Moléculaire (PBMM) dont

• UF de Génétique moléculaire (Service de Génétique)
• UF de Cytogénomique (Service de Génétique)
• UF de Biologie Moléculaire (Service de Biochimie)

MISSIONS

L’ingénieur.e sera en charge, sous la responsabilité des biologistes, du déploiement des techniques de séquençage de nouvelles générations (NGS) tant sur le plan technique que bioinformatique.

ACTIVITES PRINCIPALES

• Gestion de la plateforme NGS
• Gestion et déploiement de l’environnement bioinformatique propre au NGS
• Gestion et analyse des données produites dans le cadre de l’activité diagnostique et de développement (suites logicielles et bases de données)
• Gestion de l’assurance qualité du NGS selon la norme ISO 15189
• Assurer le support bioinformatique auprès des biologistes du PBMM
• Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine du NGS
• Assurer le développement des méthodes et applications dans le cadre de l’innovation diagnostique
• Formations des techniciens et stagiaires

DIPLÔME(S) PROFESSIONNEL(S) REQUIS OU SOUHAITE(S)

• Doctorat avec expérience dans le domaine de la biologie et du NGS et de la bioinformatique

FORMATION(S) REQUISE(S) OU SOUHAITEE(S)

• Solide formation et expérience en bioinformatique et biologie moléculaire

EXPERIENCE(S) ET CONNAISSANCE(S) SOUHAITEE(S)

• Biologie moléculaire
• Analyse bioinformatique de données NGS
• Bon niveau d’anglais
• Maîtrise de langages communément utilisés en bioinformatique (Perl, Python, awk, etc.)
• Maîtrise de l’environnement informatique UNIX

QUALITES REQUISES

• Aptitude au travail en équipe
• Autonomie et disponibilité
• Respecter scrupuleusement la règle du secret professionnel et des exigences réglementaires et éthiques en relation avec la pratique des examens de génétique moléculaire

CONDITIONS D’EXERCICE

• Temps plein
• Perspectives de CDI