Description du poste et Missions

Vous avez un goût pour l’innovation en génomique et le service aux industriels ?

Rejoignez l’équipe GeT-IT d’INRAE Transfert Metys

INRAE Transfert SAS, filiale de l’INRAE, est une société de valorisation des résultats et des technologies innovantes, issues des laboratoires de l’institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE). 

Au sein d’INRAE Transfert, le département METYS propose des prestations de services dans le prolongement des recherches menées à l’INRAE, selon une approche orientée marché, adaptée aux demandes de clients privés des secteurs industriels des biotechnologies, de l’environnement, de l’agroalimentaire et de l’agriculture.

Contexte du poste 

Adossée à la plateforme de génomique GeT de l’INRAE de Toulouse, le service propose une gamme de prestations permettant aux industriels, un accès direct aux savoir-faire et outils expérimentaux de de pointe. 

L’équipe propose un workflow complet, du prélèvement brut jusqu’à l’analyse bio-informatique et biostatistique de leurs échantillons, s’adaptant sur-mesure à leurs besoins. Aujourd’hui, une équipe de 7 personnes, autonome et intégrée à la plateforme GeT-PlaGe répond à leurs demandes analytiques en microbiologie, génomique et transcriptomique, avec les outils de séquençage de pointe (Illumina, Oxford Nanopore Technologies, PacBio et potentiellement MGI-T7) et les compétences de l’INRAE, en respectant les exigences de délais, de confidentialité, de flexibilité et de standardisations des résultats dont ils ont besoin.

Afin de répondre à une demande croissante des acteurs du secteur de la génomique, Metys recrute un.e chargé.e de projets en Bio-informatique/Bioanalyste, spécialisé.e en génomique. 

Dans un environnement de travail dynamique et à la pointe des innovations en génomique, le.a candidat.e intégrera l’équipe GeT-IT de Metys et pourra acquérir de compétences diverses en analyses bio-informatiques des données de séquences produites par les dernières technologies de séquençage.

Les activités principales : 

La fonction de Chargé.e de projets – Bio-informatique au sein du service GeT-IT consiste à réaliser des analyses de données NGS et développer des procédures bio-informatiques dans le cadre d’une activité de prestation. Les sujets adressés sont d’une grande diversité, en adéquation avec les préoccupations économiques actuelles en agronomie, élevage, alimentation et environnement.

Dans ce cadre le.a chargé.e de projet aura pour missions :

• d’assurer le transfert des innovations mises au catalogue, en interaction avec les chercheurs et ingénieurs INRAE, en particulier des plateformes GeT-PlaGe et Genotoul-Bioinfo.
• d'assumer la réalisation de prestations de métagénomique ciblée ainsi que des projets d’analyse de types : recherche de variants, assemblage petits génomes, RNA-Seq et la rédaction de rapports interactifs,
• de participer à la prospection commerciale sur les salons, à la communication et au développement du portefeuille client en collaboration avec les business-developper,
• de participer à la représentation de l’équipe GeT-IT aux différents réseaux INRAE et réseaux nationaux, sur la thématique bio-informatique et biostatistique.

Votre profil et votre parcours :

• Formation Ecole d’Ingénieur et/ou Master, spécialisation en Bio-informatique / Biostatistique / Ecologie microbienne,
• Expertise scientifique, technologique et expérience opérationnelle dans le domaine des analyses de données NGS,
• Maîtrise des différentes méthodes et techniques utilisées en bio-informatique,
• Maîtrise d’un ou plusieurs langages informatiques et de programmation (Bash, Python) et d’un ou plusieurs outils de développement (Git, Gitlab),
• Maîtrise des bases du langage R pour l’analyse biologique et biostatistique des données NGS,
• Expérience souhaitée dans l'utilisation d'un cluster de calcul (Slurm),
• Maîtrise de l'anglais technique du domaine,

Votre personnalité fera la différence :

• Reconnu.e pour votre curiosité, vous avez un attrait pour l’innovation scientifique et technique en génomique,
• Vous avez un goût pour les échanges avec des industriels de marchés divers (Elevage, agronomie, sélection variétale et animale, biotechnologie, environnement…)
• Doté.e d’un grand sens du service, vous êtes rigoureux et dynamique, capable de travailler dans un contexte de forte activité,
• Vous communiquez facilement et avez le goût du travail en équipe et des réussites collectives,

Vous souhaitez rejoindre une structure atypique, tournée vers l’innovation scientifique et le monde économique ? Vous avez des idées et souhaites explorer des sujets variés ? Vous avez de l’énergie à revendre et l’envie de vous en servir pour rejoindre une équipe dynamique et accueillante ? Ce poste est fait pour vous !