Mots-Clés

Computational Network Biology, Machine Learning, Cancer

Description

L'équipe émergente DISCO (DIgital, Systems and COmputational cancer) au sein de l'Institut ONCOLille,et le laboratoire CANTHER (UMR9020 CNRS - UMR-1277 Inserm), développe des projets liés à l'intelligence artificielle et à la biologie des systèmes du cancer. Notre objectif est d'élucider et d'étudier les réseaux de régulation dans le contexte de l'hétérogénéité tumorale et de la résistance aux thérapies.

L’IGE/R assumera la responsabilité technique du plateau CANTHER.AI (https://canther.fr/fr/plateau-de-bioinformatique-canther-xai/).

Compétences requises :

• Analyser et résoudre les problématiques bio-informatiques dans le cadre de projets de recherche collaboratifs au sein de l'équipe.

• Gérer et analyser les données "omiques".

• Concevoir, développer et déployer des outils bio-informatiques.

Connaissances requises :
 

• Connaissances approfondies en biologie des systèmes et en bio-analyse de données à grande échelle (transcriptome, protéome, altérations génomiques, mutations, ChIP-seq, criblages fonctionnels à grande échelle).

• Maîtrise des techniques d'apprentissage statistique (modèles de régression, clustering, inférence et fouille de graphes, deep learning) ainsi que des méthodes de modélisation, d'analyse et de simulation de réseaux de régulation (concepts de la théorie des graphes, équations différentielles, formalisations booléennes ou logiques).

• Maîtrise d'au moins un langage de programmation parmi R et Python, ainsi que des connaissances en technologies Web.