Ingenieur·e en développement logiciel en bioinformatique

 CDD · IR  · 12 mois (renouvelable)    Bac+5 / Master   Plateforme GenOuest - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA) · Rennes (France)

 Date de prise de poste : 15 janvier 2024

Mots-Clés

plateforme développement gestion de données hpc

Description

L'IRISA est l'un des plus grands laboratoires de recherche français (plus de 850 personnes) dans le domaine de l'informatique et des technologies de l'information. Structuré en sept départements scientifiques, l'IRISA est un centre de recherche d'excellence dont les priorités scientifiques sont la bio-informatique, la sécurité des systèmes, les nouvelles architectures logicielles, la réalité virtuelle, l'analyse des big data et l'intelligence artificielle. L'IRISA est au cœur de la transition numérique de la société et de l'innovation en matière de cybersécurité, de santé, d'environnement et d'écologie, de transport, de robotique, d'énergie, de culture et d'intelligence artificielle.

 Le poste est affecté à l’IRISA sur la plate-forme bio-informatique GenOuest. Cette plate-forme d’envergure nationale propose un ensemble complet de services de calcul et de gestion de données à une large communauté locale et nationale. Parallèlement à cette activité de service, la plate-forme porte une activité de R&D avec des développements portant sur la gestion de la donnée scientifique ainsi que sur la mise en place d’outils de gestion de plates-formes.

D’un point de vue technique, la plate-forme GenOuest propose une infrastructure de calcul et de stockage basée sur de serveurs Linux. Ces serveurs sont associés à plusieurs serveurs de stockage capacitifs ou rapides totalisant environ 2 Po. Cette infrastructure est utilisée par une communauté de plus de 800 personnes.

 

Votre mission

 

Sous la responsabilité du Directeur Technique et du responsable du Service Expérimentation et Développement (SED) de l’IRISA, vous pilotez et contribuez aux différents projets informatiques, de la conception à la mise en œuvre, pour la plate-forme bio-informatique. À ce titre, vous assurez des fonctions de veille technologique et de transfert des recherches en bio-informatique. Vous pourrez être amené à encadrer des ingénieurs contractuels engagés dans des programmes de développement sur la plate-forme.

Vous contribuez à la stratégie de la plate-forme en explorant diverses technologies susceptibles d’enrichir l’offre technologique de la plate-forme, notamment dans le domaine de l’intelligence artificielle.

  

Vos activités principales :

 - Piloter la stratégie logicielle de la plate-forme GenOuest, identifier les pistes technologiques à explorer et proposer des projets.

- Piloter les projets de R&D de la plate-forme (projets internes, projets en collaboration)

- S’approprier la base de code de la plate-forme

- S’impliquer dans les réseaux de compétence au niveau national et international.

- Former et assurer le transfert des connaissances et des savoir-faire : diffuser et valoriser les méthodes et outils développés.

- Participer aux actions de support et de formation pour les utilisateurs.

Le profil idéal

 

Bonne connaissance de l’environnement Linux

Connaissance en développement web

Connaissance des technologies du cloud (Openstack)

Connaissances en architecture système et réseau

Connaissances des technologies de virtualisation et conteneurisation (Docker, Singularity)

Connaissances de déploiement automatisé (Terraform, Ansible)

Bonnes pratiques de développement : versioning Git, intégration continue (GitHub Actions, GitLab CI), versioning et outils de collaboration associés (GitHub, Gitlab).

Sensibilisation aux approches DevOps

Connaissance des langages utilisés en bio-informatique (Python) et en développement web (Javascript)

Connaissance des environnements de calcul HPC (Slurm)

La connaissance de la bio-informatique et de ses problématiques serait un plus

 

Capacité à travailler en mode projet et en équipe

Capacité à travailler à distance

Capacité d’écoute et sens du contact

Capacités rédactionnelles

Capacité à apprendre et se former en continu dans un contexte scientifique en évolution rapide.

Maîtrise orale et rédactionnelle de la langue anglaise

 

Conditions particulières d’exercice :

Déplacements à prévoir suivant les besoins des divers projets, sur le territoire national ou européen.

Emploi localisé sur le campus universitaire de Beaulieu

Candidature

Procédure : Candidater via le site en lien

Date limite : 15 décembre 2023

Contacts

 Olivier Collin

 olNOSPAMivier.collin@irisa.fr

 https://univ-rennes.nous-recrutons.fr/poste/4c6jhvv2gy-ingenieur%C2%B7e-en-developpement-logiciel-en-bio-informatique/

Offre publiée le 4 décembre 2023, affichage jusqu'au 15 janvier 2024