Mots-Clés

vésicules bio-marqueurs protéomique bioanalyse développement

Description

Contexte :
Au sein de l’Institut Curie, l'un des plus importants centres européens de recherche contre le cancer, le laboratoire de spectrométrie de masse protéomique (LSMP) et l'unité U900 « Cancer et génome : bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie » (unité mixte INSERM, Mines ParisTech, Institut Curie) combinent des activités de recherche et de soutien aux équipes de recherche de l’institut par le biais de leurs plateformes CurieCoreTech Spectrométrie de masse Protéomique et de bioinformatique (CuBiC).

Dans le contexte d'une collaboration avec l'unité INSERM U932 (équipe Vésicules extracellulaires, réponses immunes et cancer), nous recherchons un(e) stagiaire pour contribuer à l'étude de marqueurs protéiques spécifiques de vésicules extracellulaires impliquées dans le transfert de signaux complexes entre cellules.

Missions :
Nous proposons un stage co-encadré par les 3 partenaires dont la mission principale sera de participer au développement d'un outil de profilage protéique de ces vésicules à partir de données de spectrométrie de masse quantitative haut-débit.
-Le/la stagiaire devra se familiariser avec le type de données utilisées.
-Il/elle pourra s'inspirer des approches biostatistiques et outils déjà décrits dans la littérature.
-Il/elle participera également à l'intégration de la solution développée dans l'application web de gestion et d'analyse de données MS utilisée à l'Institut Curie.
-Il/elle pourra s'appuyer sur l'expertise des autres bioinformaticiens (statisticiens, bio-analystes, dévelopeurs) des équipes impliquées pour mener à bien ses missions.

Profil :
Maîtrise des langages Python et/ou R (programmation et bioanalyse).
Expérience pratique dans l’utilisation des systèmes Unix/Linux et du Shell.
Connaissance de l'outil de gestion de versions: Git (gitlab/github).
Des connaissances en HTML5, CSS3 et JavaScript seraient les bienvenues.
Notions de base de biologie.
Des notions de spectrométrie de masse protéomique ne sont pas nécessaires mais seraient un avantage.