Société Française de Bioinformatique

Mission principale:

La personne recrutée aura pour mission :

• Gérer et coordonner la plateforme de bio-informatique du CRC ;
• Concevoir et organiser le stockage et le traitement de données issues de la recherche translationnelle du CRC (omiques bulk/single cell/spatial, imagerie, …) ;
• Développer des pipelines dédiés à l'analyse des données ;
• Traiter et analyser des données biologiques

Activités principales :

• Accompagner (orienter et conseiller) les chercheurs dans leurs projets, pour :

           - Définir le plan expérimental (données à recueillir, plan d’analyse, identification des méthodes appropriées)

-          - Analyser les données (réalisation des analyses et interprétation des résultats)

• Développer des pipelines bioinformatiques.
• Concevoir et optimiser de nouvelles méthodes d’analyse
• Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales
• Gérer les moyens humains, techniques et financiers alloués
• Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques de l'analyse des données biologiques
• Participer à l’animation du club bio-informatique du CRC
• Participer à des réseaux professionnels d'échange de compétences
• Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité et dans un contexte interdisciplinaire
• Participation à la démarche qualité des Plateformes du CRC, afin d’obtenir l’accréditation de la nouvelle plateforme
• Aider les autres plateformes du CRC dans le développement d’outils d’analyse automatique des données qu’elles génèrent
• Rédiger des protocoles d’utilisation des outils et des méthodes mises en place/utilisées
• Soumission de données dans des bases internationales adaptées.

Poste ouvert aux fonctionnaires 

Connaissances :

• Connaissances en biologie moléculaire et biologie cellulaire
• Connaissance des principales méthodes bioinformatiques d’analyse de données (en particulier de données omiques, RNAseq, Single-cell RNAseq, WES, WGS, ATACseq, Methylation….)
• Très bonne maîtrise de langages de programmation (R, python, …)
• Connaissance des outils de développement de pipelines bioinformatiques (ex. Docker, Nextflow, …)
• Connaissance des outils de data management
• Système d'information / Architecture du système d'information
• Organisation et fonctionnement de la recherche et de l’enseignement supérieur en France
• Connaissance de la réglementation applicable au domaine d’activité (gestion des données, mise à disposition et protection des données…)
• Très bonne maitrise de l’anglais scientifique

Savoir-faire :

• Capacité à encadrer une équipe
• Élaborer des outils pédagogiques
• Communication scientifique, présentation des résultats

Aptitudes :

• Bon relationnel et sens du travail en équipe
• Disponibilité et réactivité
• Organisation, ponctualité et rigueur
• Sens du service public
• Sens critique
• Autonomie
• Esprit critique, attitude positive, fortes compétences en matière de résolution de problèmes et adaptabilité à de nouvelles données et
• Créativité

Expérience souhaitée :

• 3 à 4 ans

Niveau de diplôme et formation :

• Doctorat ou diplôme d’ingénieur équivalent