Mots-Clés

Développement logiciel Génomique Big data

Description

Contacts :

alban.lermine@aphp.fr laurent.frobert-ext@aphp.fr

Description du poste :

Développeur full stack

https://laboratoire-seqoia.fr

Description du projet SeqOIA :

Le projet SeqOIA (Sequencing, Omics, Information Analysis), la plateforme génomique de Paris Région, porté par l’Assistance Publique Hôpitaux de Paris, l’Institut Curie et Gustave Roussy a été sélectionné par le Ministère des Solidarités et de la Santé dans le cadre de l’appel à projet pour la mise en œuvre et l’évaluation de projets pilotes de plateformes de séquençage très haut débit à visée sanitaire, du Plan France Médecine Génomique 2025 qui promeut la mise en œuvre et la prospective sur 10 ans des conditions de l’accès au diagnostic génétique en France.

Doté d’une équipe bioinformatique dédiée (SeqOIA-IT), SeqOIA développe et déploie ses propres solutions logicielles innovantes pour la prescription médicale (SPICE), l’analyse et l’interprétation des données (gLeaves). Elle s’appuie par ailleurs sur une infrastructure de calcul et stockage HPC de 4000+ cœurs, 18+To RAM, 2 Po de scratch et 10 Po d’archivage.

Formations et/ou qualifications :

Bac + 5 – Grande école d’ingénieur ou formation universitaire équivalente (M2, PhD) en bioinformatique.

Description des missions de l’ingénieur Bioinformatique, Intégration :

Sous la hiérarchie du développeur senior, le (la) candidat(e) exerce les missions suivantes :

• Développer les fonctionnalités définies pour l’application gLeaves
• Anticiper les évolutions éventuelles et les incidences des actions
• Participer aux phases de tests des fonctionnalités développées
• Intervenir sur l’évolution d’applications déjà réalisées auxquelles il faut apporter des améliorations et des développements complémentaires
• Assurer l’interopérabilité entre les briques logicielles de la plateforme SeqOIA et les systèmes d’information des partenaires du projet

Les compétences requises :

Le (la) candidat(e) devra disposer des compétences suivantes :

• Outils de développement front : Svelte, OpenUI5, JS, CSS
• Outils de développement back: Java, Python, liste non limitative (Rust,…)
• SGBDR: Mysql, Mongodb, elasticsearch
• Services Web REST
• OS : Environnement Linux
• Excellentes qualités relationnelles et organisationnelles
• Adéquation avec les valeurs de l’hôpital public et d’une appétence pour les défis ambitieux 
• Faire preuve de rigueur et d’une capacité organisationnelle.

Enfin, nous recherchons avant tout une personne ayant d’excellentes qualités relationnelles et organisationnelles, aimant travailler en équipe, et disposant d’une adéquation avec les valeurs de l’hôpital public, d’une appétence pour les défis ambitieux, et d’une sensibilité aux valeurs d’intégrité scientifique.

Conditions de travail et évolutions du poste :

Poste à 100%. Recrutement par voie de mise à disposition auprès du GCS.

Possibilité de jours de télétravail une fois le poste maîtrisé et sur certaines missions.