Mots-Clés

data management cancer immunotherapie metagenomique hematologie python rest sql docker

Description

Description du poste :

Gustave Roussy (2700 employés), premier centre européen de lutte contre le cancer et 4ème mondial, cherche à recruter un(e) Bio-informaticien(ne) / Data Manager pour participer au développement de la médecine de précision, oncologie computationnelle, et des projets relatifs aux cancers du poumon (PREVALUNG), à la résistance aux immunothérapies (IMMUNOLIFE), aux liens entre microbiome et cancer (ONCOBIOME), ainsi qu’aux mécanismes expliquant le passage de l’état pré-leucémique à l’hémopathie maligne secondaire (CLONAL INTERCEPTION).

Les principales missions seront les suivantes :

• Collecter et labelliser les données omiques afin de les verser dans des entrepôts de données
• Alimenter des bases de données et portails de données
• Développer des applications middleware pour connecter ces bases et portails de données
• Coordonner l’échange des données omiques
• Produire des rapports et métriques sur la qualité des données et métadonnées collectées

Connaissances et compétences professionnelles :

• Programmation : Shell, au moins un langage de programmation parmi Python ou Java, notion de programmation web (Html/JavaScript) et de web service REST, base de données SQL, gestion de code source Git, conteneurisation Docker/Singularity
• Connaissances générales scientifiques

Expertise et compétences interpersonnelles :

• Adaptabilité
• Capacité à interagir et à travailler en équipe
• Rigueur, méthode et dynamisme

Qualifications :

Bac+5/Master (bio-informatique/informatique) avec de l’expérience en gestion et traitement des données et une appétence pour le développement informatique/bio-informatique.

Relation hiérarchiques et fonctionnelles principales :

Le ou la candidat(e) sera sous la responsabilité hiérarchique de Marc DELOGER, PhD, au sein de l’équipe structuration des données (DRE058) du pôle data de la direction de la recherche.

Il/elle sera également intégrée à l’équipe immunologie des tumeurs et immunothérapies du Pr Laurence ZITVOGEL (UMR 1015) ainsi qu’à l’équipe d’oncologie computationnelle (UMR 981) d’Elsa BERNARD, PhD.

Il/elle sera amené(e) à interagir avec les médecins, biologistes, et chercheurs impliqués dans les projets de ces deux équipes.

Type de contrat :

CDI de Mission, d’une durée initiale de 2 ans, à pourvoir dès que possible. Le poste de travail sera sur le site de Villejuif (94) avec possibilité de télétravail jusqu’à 3 jours par semaine

Avantages :

• Passe Navigo annuel pris en charge à 60%
• Restauration collective, 2 cafeteria et 1 "food truck"
• Comité d’entreprise : tickets cinéma à 5€, chèques vacances, participation financière à des locations saisonnières/séjours etc…

Prolongement de la ligne de métro 14 au pied de l’hôpital fin 2024 et ligne de métro 15 sud en 2025.