Mots-Clés

Traitement de données omics, épigénétique, pommier

Description

CONTEXTE 

Un poste d’Ingénieur(e) d’Etudes en CDD (avec possibilité de CDI par la suite) est proposé à l’Université d’Angers à partir de Février 2024.  Les recherches seront conduites dans l’équipe VALEMA (VALorization of Epigenetic Marks in plAnts, chef d’équipe JM Celton) à l’Institut de Recherche en Horticulture et Semences - IRHS (https://www6.angers-nantes.inrae.fr/irhs/Recherche/VALorization-of-Epigenetic-Marks-in-plAnts). L’équipe VALEMA développe des projets de recherche en génomique végétale et plus particulièrement en épigénétique sur plantes horticoles en relation avec des stress abiotiques. Ces projets de recherche visent à comprendre les mécanismes physiologiques, transcriptomiques et épi/génétiques qui permettent aux plantes pérennes de s’adapter à diverses conditions environnementales, dans un contexte global de changement climatique.

Les missions de l’Ingénieur(e) d’Etudes s’inscrivent dans ce contexte au sein d’une équipe composée de 8 personnes (1 MdeC, 1CR, 1 IR, 2 TR et 3 PhD). Il/elle collaborera étroitement avec l’ensemble des membres de l’équipe et travaillera sur les différents projets de recherches initiés par l’équipe. L’Ingénieur(e) d’Etudes sera également amenée à collaborer avec les différentes équipes de l’IRHS, ainsi que d’autres équipes de recherche en France et à l’international.

MISSIONS PRICIPALES et ACTIVITES

Mission principale : Ingénieur(e) d’Etudes en Expérimentation et traitement de données

Activités principales :

1. Coordonner la mise en œuvre des expérimentations sur le modèle pommier dans les différents projets de recherche de l’équipe VALEMA en assurant la traçabilité des données, aussi bien numériques que biologiques, depuis la serre ou le verger, jusqu’au laboratoire et l’analyse.
2. Planifier, développer et réaliser les expériences en Biologie Moléculaire liées aux différents projets.
3. Mettre en place les outils bio-informatiques nécessaires à l’analyse des données
4. Assurer le traitement bio-informatique des données

L’Ingénieur(e) d’Etudes devra se familiariser avec le modèle pommier (et les plantes de manière générale), se former aux techniques de Biologie Moléculaire et aux outils bio-informatiques liés aux thématiques de recherche de l’équipe.

Les compétences que nous recherchons :

Idéalement Bac +5 (minimum réglementaire Bac +3)

Esprit d’équipe

Connaissances dans le recueil, l’analyse et le traitement de données -omiques

Connaissances appréciées en traitement de données de phénotypage

Utilisation de logiciels spécifiques à l’activité / au domaine

Connaissances en Biologie végétale : culture cellulaire et biologie moléculaire

Créativité / sens de l’innovation

Capacité de raisonnement analytique