Mots-Clés

Bioinformatique NGS ADN mitochondrial bases de données processus qualité pipeline

Description

L’ingénieur hospitalier est chargé du traitement des données issues du séquençage nouvelle génération (NGS)
concernant les services d’Hématologie et de Pathologie pour l’analyse d’exomes et de l’ADN mitochondrial. Avec
les biologistes référents des analyses par NGS, il conçoit et organise la collecte et le traitement de données,
conduit et contrôle l’ensemble des différentes phases d’exploitation.
Il a pour mission de :
- Réaliser en lien avec la cellule bio-informatique le suivi des maintenances des logiciels.
- Assurer en lien avec la DSI des solutions de stockage des données.
- Participer au choix ainsi qu’à la mise en service des nouveaux outils et équipements bio-informatique en
contrôlant l’application des règlementations et obligations.
- Développer de nouveaux outils répondant aux besoins du corps technique et médical.
- Assurer une veille technique, réglementaire et normative.
- Collaborer avec la cellule qualité à la gestion des risques techniques et environnementaux.
- Tenir à jour la base de données de logiciels dédiés au séquençage nouvelle génération et applications du
secteur.
- Assurer en collaboration avec les fournisseurs le bon fonctionnement et la mise à jour des outils propriétaires
en lien avec le NGS

COMPETENCES TECHNIQUES
 Utilisation avancée des systèmes Linux
 Connaissance de différents langage de programmation / script (Python/Perl/Java/Bash/R…)
 Conception, développement et maintenance de logiciels
 Conception et utilisation d’architectures système pour le stockage et l’analyse de grande quantité de
données issues du séquençage haut débit
 Conception, gestion et maintenance de base de données
 Avoir une bonne connaissance des différentes techniques de biologie moléculaire, ou être en capacité
de l’acquérir rapidement
COMPETENCES RELATIONNELLES
 Etre capable de travailler en équipe
 Communiquer et transmettre son savoir à l’ensemble du personnel du plateau
 Savoir se positionner et déterminer les limites de son domaine de compétences
 Avoir des facultés d’intégration et d’adaptation au changement
 Avoir le sens du service public
 Maîtrise de l’anglais
COMPETENCES ORGANISATIONNELLES
 Être autonome et réactif
 Savoir gérer son activité et être force de proposition pour améliorer les performances
 Savoir faire face à des situations d’urgence
 Analyser et gérer les priorités
 S’investir dans les différentes activités du service
 S’inscrire dans un processus d’autoévaluation