Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

Virus

Description

Le groupe du Dr. Jean-Louis Mergny (LOB, Ecole Polytechnique, Palaiseau) s’intéresse aux conformations inhabituelles des acides nucléiques. L’équipe souhaite recruter un(e) post-doctorant(e) en bioinformatique pour prendre en charge l’analyse de séquences virales. Ce poste, d’une durée de 12 mois éventuellement renouvelable, est ouvert grâce au soutien de l’Agence Innovation Défense (AID) via le Centre Interdisciplinaire d’études pour la défense et la sécurité (CIEDS https://www.ip-paris.fr/cieds). La candidature de ressortissants de l’union européenne est encouragée.

L’Ecole Polytechnique (https://www.polytechnique.edu/en/news) est l’une des institutions scientifiques et d’ingénierie les plus prestigieuses de France et membre fondateur de l’Institut Polytechnique de Paris. l’École Polytechnique combine un enseignement de haut niveau, une recherche de pointe et une forte tradition d’excellence, ainsi qu’un accès à un vaste réseau mondial de partenaires académiques et industriels.

Le Laboratoire d’Optique et Biosciences (LOB ; https://lob.ip-paris.fr) est une unité interdisciplinaire à l’interface Physique – Biologie, placée sous les tutelles de l’Ecole Polytechnique, du CNRS et de l’Inserm.

Missions principales :

• Analyser des génomes viraux.
• Utilisation d’outils de prédiction de formation de G-quadruplexes (G4-Hunter).
• Définir des stratégies et outils à mettre en oeuvre pour l’analyse de jeux de données biologiques (par exemple, ChIP-seq, Cut & Tag, RNA-seq, G4Access).
• Utiliser des bases de données, d’outils et d’infrastructures de calcul haute performance pour réaliser les analyses.
• Créer de nouveaux outils bioinformatiques pour l’analyse de données génomiques
• Assurer la qualité et la reproductibilité des résultats obtenus.
• Communiquer les résultats lors de réunions ou séminaires de travail.

Profil :

• Solides connaissances en analyse de génomes.
• Connaissances en biologie cellulaire et moléculaire, en génomique et génétique.
• Maîtrise des langages R, Python et Bash.
• Maîtrise d’outils statistiques appropriés aux analyses réalisées.
• Capacités rédactionnelles.
• Sens critique et force de décision.
• Bon niveau d’anglais.
• Capacité à travailler de manière autonome.

Formation requise :

• Doctorat avec une expérience en bioinformatique.

Contrat :

• Veuillez soumettre vos candidatures (en anglais ou français) par mail à Jean-Louis Mergny
  (jean-louis.mergny@polytechnique.edu) avec l’objet “Post-doc Bioinfo LOB”. Inclure un CV, une
  lettre de motivation et le contact de personnes susceptibles de pouvoir rédiger une lettre de
  recommandation.
• Prise de poste escomptée: Poste disponible immédiatement.
• Salaire: selon l’ancienneté après le doctorat ; grille Ecole Polytechnique.