Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

métabolisme systems biology plancton tara océan adaptation

Description

Dans un contexte de changement climatique, cette thèse s’inscrit dans le projet ANR Seascales et vise à comprendre les mécanismes d’adaptation thermique des espèces planctoniques eucaryotes, notamment Bathycoccus prasinos, une espèce cosmopolite présente dans des environnements thermiques très variés. L’objectif principal est d’identifier comment ces organismes s’adaptent à différentes températures, à travers une approche intégrative combinant génomique, protéomique et modélisation métabolique.

Le travail portera sur l’analyse des variants génétiques et protéiques au sein des populations naturelles, la reconstruction de réseaux métaboliques à partir de génomes de souches adaptées au froid ou aux températures modérées, et l’étude du lien entre ces variants, les fonctions métaboliques et l’adaptation thermique. Une étape importante consistera à identifier des cibles enzymatiques candidates pour des validations expérimentales par des partenaires du projet.