Mots-Clés

NGS Génétique Maladies rares

Description

PRESENTATION GENERALE DU SECTEUR D’ACTIVITE

Les laboratoires de génomique humaine au sein du Plateau de Biologie et Médecine Moléculaire (PBMM) du CHU d’Angers sont constitués :

• D’une UF de Génétique moléculaire au sein du service de Génétique réalisant le diagnostic pré- et post-natal de pathologies héréditaires. Son activité est principalement centrée sur les pathologies suivantes : maladies mitochondriales, neurogénétique, mucoviscidose, myopathies, hémochromatose, maladie de Huntington, sclérose tubéreuse de Bourneville, maladie de Charcot Marie Tooth, anomalies de la réceptivité hormonale et oncogénétique somatique et constitutionnelle.
• D’une UF de Cytogénomique au sein du service de Génétique réalisant le diagnostic réalisant le diagnostic pré- et post-natal de pathologies chromosomiques et génomiques.
• D’une UF de biologie moléculaire au sein du service de biochimie. Son activité est principalement centrée sur les pathologies suivantes : maladies mitochondriales, réceptivité hormonale, oncogénétique.

ACTIVITES

MISSIONS

L’ingénieur sera en charge, sous la responsabilité des biologistes, du développement et du déploiement des analyses bioinformatiques en lien avec les techniques de séquençage de nouvelles génération (panels de gènes, exome, RNA-seq, épigénétique).

ACTIVITES PRINCIPALES

• Gestion de la plateforme NGS
• Gestion et déploiement de l’environnement bioinformatique propre au NGS
• Gestion de l’assurance qualité du NGS selon la norme ISO 15189
• Gestion et analyse des données produites dans le cadre de l’activité diagnostique et de développement (suites logicielles et bases de données)
• Assurer le support bio-informatique auprès des biologistes du PBMM
• Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine du NGS
• Assurer le développement des méthodes et applications dans le cadre de l’innovation diagnostique
• Formations des techniciens et stagiaires

ACTIVITES SPECIFIQUES

Analyses bioinformatiques dans le cadre de la génomique, transcriptomique et épigénomique.

EXIGENCE DU POSTE

DIPLÔME(S) PROFESSIONNEL(S) REQUIS OU SOUHAITE(S)

Doctorat avec expérience dans le domaine de la biologie, du NGS et de la bioinformatique.

FORMATION(S) REQUISE(S) OU SOUHAITEE(S)

Solide formation et expérience en bioinformatique et biologie moléculaire.

EXPERIENCE(S) ET CONNAISSANCE(S) SOUHAITEE(S)

• Connaissances approfondie en biologie moléculaire
• Connaissances théorique et pratique de l’analyse bioinformatique de données NGS
• Maîtrise de l’environnement informatique UNIX
• Maîtrise des langages communément utilisés en bioinformatique (Bash, Python, R)
• Maîtrise du système de gestion de workflows Nextflow
• Bon niveau d’anglais

QUALITES REQUISES

• Aptitude au travail en équipe
• Autonomie et disponibilité
• Respecter scrupuleusement la règle du secret professionnel et des exigences réglementaires et éthiques en relation avec la pratique des examens de génétique moléculaire

CONDITIONS D’EXERCICE

CDD de 12 mois, renouvelable - Temps plein - Poste à pourvoir à la rentrée 2025 : Octobre/Novembre
Perspectives de CDI
Rémunération selon grille indiciaire (corps des ingénieurs hospitaliers)