Mots-Clés
données omiques
pipelines
cluster de calcul
Python
R
Snakemake
Nextflow
FAIR data
HPC
analyse de séquençage
RNA-seq
visualisation de données
Git
veille technologique
formation
accompagnement
autonomie
Description
La plateforme iPOP-UP (Université Paris Cité) recrute un·e ingénieur·e en bioinformatique en poste permanent, pour renforcer l’accompagnement des équipes de recherche dans leurs analyses de données omiques (transcriptomique, génomique, Ribo-seq…).
📍 Lieu : Campus Paris Rive Gauche – UMR Epigénétique et Destin Cellulaire (UMR 7216)
📅 Prise de fonction souhaitée : 1er novembre 2025
🧪 Missions principales :
Accompagnement des utilisateurs (chercheurs, ingénieurs, étudiants) dans l’analyse de leurs données omiques ;
Développement de workflows reproductibles et adaptables à différents types d’expériences ;
Participation à l’animation scientifique de la plateforme (ateliers, formations, séminaires) ;
Implication dans des collaborations avec d’autres plateformes bioinfo (Genom’IC, IFB, etc.).
🧠 Profil recherché :
Formation en bioinformatique ou en analyse de données en biologie (niveau M2, doctorat ou équivalent) ;
Bonne maîtrise des analyses RNA-seq, Ribo-seq ou génomiques ;
Expérience en scripting (R, Python, bash), et idéalement en environnement de calcul (cluster) ;
Esprit collaboratif, autonomie et goût pour le support aux équipes de recherche.
📎 Fiche de poste et lien pour postuler ici :
👉 https://tinyurl.com/IEipopup