Mots-Clés
sql
electronic health record
dossier patient informatisé
biologie médicale
intégration de données
Description
INGENIEUR D’ETUDE DONNEES DE SANTE, EPIDEMIOLOGIE
Projet Structuration des données de biologie médicale
Votre formation Ecole d’ingénieur, Master 2 ou PhD
Vos compétences Modélisation et analyse de données de santé, programmation SQL, Python, R
Localisation Hôpital de la Croix-Rousse, Lyon
Durée 1 an renouvelable (3 ans max)
Les ‘plus’ du poste Domaine de la santé, travail en milieu hospitalier, projet en partenariat public/privé, objectifs concrets d’amélioration des prescriptions de biologie médicale
Partenaires du projet
• Hospices Civils de Lyon
• Centre International de Recherche en Infectiologie, Université de Lyon, Inserm U1111
Localisation
Institut des Agents Infectieux, Hôpital de la Croix-Rousse
Equipe Public Health, Epidemiology & Evolutionary Ecology of Infectious Diseases
103 Grande Rue de la Croix-Rousse, 69004 Lyon
Contexte
Le projet OptimaBio, soutenu par la Banque Publique d’Investissement, est un projet de R&D permettant de développer une solution logicielle d’aide à la prescription des actes de biologie médicale en milieu hospitalier, en utilisant l’intelligence artificielle. Ce projet vise à optimiser la pertinence des prescriptions en réduisant le nombre d’actes redondants et/ou inutiles, et en proposant des examens complémentaires pertinents au regard du parcours de soins du patient.
Mission
Vous contribuerez au développement et à l’exploitation d’un système d’intégration de données de santé, centrées sur la biologie médicale (biochimie, hématologie, bactériologie, etc). Ce système comprend une base de données fédérative, permettant la mise en relation de données hétérogènes et complexes issues d’origines diverses dont des logiciels métier de biologie médicale et de gestion hospitalière.
Vos missions principales seront :
• Modéliser la représentation de nouvelles données au sein d’un modèle de données
• Modéliser l’alignement (enrichissement) de ces données à des standards internationaux tels LOINC, SNOMED, NCBI
• Exploiter la base de données par l’analyse de tendances et la construction de modèles
• Définir des indicateurs de qualité des données et fournir des rapports sur ces indicateurs
• Construire des ensembles de données pseudonymisées et/ou anonymisées selon des cahiers des charges pré-établis
• Interagir avec plusieurs corps de métier (informaticiens hospitaliers, cliniciens, épidémiologistes) pour définir les formats de données en entrée et en sortie de la base de données
• Communiquer autour de vos travaux au sein des équipes multidisciplinaires des services hospitaliers et des partenaires industriels, ainsi que dans les conférences et congrès auxquels vous participerez.
Profil
• Diplômé d’école d’ingénieur our Master 2 (Bac+5) ou docteur (Bac+8) avec une spécialisation en données de santé, informatique générale, data management. Des connaissances dans le domaine de l’intelligence artificielle (IA générative, LLM) seront considérées favorablement.
• Vous êtes capable de programmer efficacement (SQL, Python, R) tout en veillant à ce que votre code soit évolutif, documenté et facilement réutilisable.
• Vous êtes autonome, rigoureux, et faites preuve d’une curiosité technique et scientifique.
• Vous avez le sens de la communication écrite et orale dans un environnement multidisciplinaire.
• Vous parlez couramment anglais et êtes en mesure de réaliser une étude bibliographique ou de communiquer dans cette langue au sein d’une équipe internationale.
Pour postuler
Envoi CV + lettre de motivation à :
Jean-Philippe RASIGADE, jean-philippe.rasigade@univ-lyon1.fr, Hospices Civils de Lyon / Centre International de Recherche en Infectiologie.
Prise de fonction en novembre 2025. Contrat de 1 an renouvelable deux fois selon performances (3 ans max).