Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

Ecology Galaxy Biodiversité Conservation Antarctique

Description

Contexte scientifique ou opérationnel

L’Aire Marine Protégée de l’Antarctique de l’est a été proposée en 2011 à la CCAMLR. Les données qui ont permis de réaliser la biorégionalisation de la zone en préalable au Systematic Conservation Planning sont donc datées de même que les méthodes d’analyse. Depuis lors les écosystèmes de la zones ont subi des changements importants causés par le vélage en 2010 de la langue glaciaire du Mertz. Il convient donc de mettre à jour la proposition d’AMP et ce faisant tester les effets des changements écosystémiques sur la priorisation des zones de protection.

Objectifs du stage

Il s’agira pour la/le stagiaire, en suivant les principes FAIR, de mettre en evidence les transformation des écosystèmes de l’Est Antarctique sur la période 2010-2025, après le vélage de la langue glaciaire du Mertz. La/le stagiaire produira les biorégionalisations pélagiques et benthiques sur les périodes 2000-2010 et 2011-2025 afin de les comparer et identifier les changements intervenus. La/le stagiaire identifiera les zones de protection en suivant la méthode utilisée en 2011 afin de les comparer aux zones identifiées auparavant. Cette comparaison permettra de tester la validité de l’AMP propose.

Démarche expérimentale

Il s’agira de construire les codes sources permettant d’interroger les bases de données internationales où les jeux de données sont deposés, de récupérer auprès des chercheurs les codes sources ayant permis d’élaborer les bioregionalisations benthiques et pélagiques afin de pouvoir reproduire les analyses. Il s’agira d’appliquer ces codes sur deux jeux de données sur deux périodes de temps différentes afin de pouvoir identifier les changements subis par les écosystèmes. L’évaluation des zones de protection prioritaire pourra se faire en suivant les principes CAR (comprehensiveness, adequacy and representativeness) ou de façon plus « objective » en utilisant les méthodes de spatial planning implémentées dans logiciels Marxan ou Prioritizer.

-Rôle du stagiaire dans le déroulement du projet (750 caractères maximum espaces compris) :
La/le stagiaire développera les codes permettant l’interrogation des bases de données internationales, notamment Mercator, améliorera les codes permettant les biorégionalisations pélagiques et benthiques, comparera les cartes obtenues afin d’identifier les zones ayant subi des changements et leur intensité. Elle/il identifiera les zones de protection prioritaire afin de les comparer à celles de l’AMP.