Mots-Clés
Dévelopement web
Visualisation
Génomique comparative
Description
Catégorie
Catégorie A (cadre)
Domaine / métier
SCIENCE - BAP E : Informatique (scientifique), Statistiques et Calcul scientifique - E2E47 - Ingénieur-e en calcul scientifique
Corps
Ingénieur d’Études
Intitulé du poste
Ingénieur F/H en développement web, et visualisation
Type de contrat
CDD de 12 mois
Descriptif de l’employeur
L’IRD est un organisme de recherche public français pluridisciplinaire qui, depuis près de 80 ans, s’engage dans des partenariats équitables avec les pays du Sud et dans les Outre-mer français.
Acteur de l’agenda international pour le développement, ses priorités s’inscrivent dans la mise en œuvre des Objectifs de développement durable (ODD).
Ensemble, scientifiques et partenaires de l’Institut proposent des solutions concrètes pour répondre aux défis globaux auxquels les sociétés et la planète font face. Cette relation gagnante-gagnante fait de la science et de l’innovation des leviers majeurs du développement.
L’Institut est placé sous la double tutelle du ministère chargé de l’Enseignement supérieur et de la Recherche et de celui chargé des Affaires Étrangères.
Descriptif de la structure et du projet
Vous rejoindrez le projet BRIDGE-COFFEA (financé par l’ANR), porté par l’UMR DIADE (IRD, CIRAD, Université de Montpellier), et accueilli dans l’unité partenaire AGAP (CIRAD, INRAE, Institut Agro et Université de Montpellier).
Ces deux unités étudient différents modèles de plantes tropicales et méditerranéennes, leur fonctionnement, leur adaptation et leur diversité.
Mission relative au poste
Vous serez recruté(e) dans le cadre du projet BRIDGE-COFFEA, un projet de recherche porté par l’IRD, visant à explorer et valoriser la diversité génomique du genre Coffea, sur une soixantaine d’espèces de caféiers.
Les missions du poste incluent de :
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Concevoir et développer des outils web interactifs de visualisation de données génomiques (pangénomes, structures génétiques, phylogénies), incluant des interfaces frontend ergonomiques et performantes pour l’exploration de jeux de données complexes.
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Développer les composants backend nécessaires à l’accès, au traitement et à la structuration des données (APIs, services applicatifs), ainsi que la mise en place et l’interrogation de bases de données relationnelles et/ou NoSQL.
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Assurer la préparation, la transformation et l’optimisation des données scientifiques en vue de leur visualisation et de leur exploitation.
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Adapter, intégrer et réemployer des outils ou visualisateurs existants en fonction des besoins du projet.
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Documenter les développements, garantir la qualité du code et contribuer à la pérennisation des outils produits.
Vous serez sous la supervision de Marilyne Summo (Ingénieure en développement et visualisation, CIRAD), Jean-François Dufayard (chercheur en bioinformatique, CIRAD) et de Romain Guyot (coordinateur BRIDGE-COFFEA, chercheur en génomique des caféiers, IRD).
Le profil que nous recherchons
Nous recrutons un(e) Ingénieur(e) d’étude en développement web pour contribuer à la mise en place d’outils de visualisation de données génomiques, en appui à des projets de recherche pluridisciplinaires portant sur la biodiversité, la génomique et la santé des écosystèmes.
Le ou la candidat(e) interviendra au sein d’équipes scientifiques engagées dans des programmes de recherche à fort impact sociétal, souvent menés en partenariat avec des institutions du Sud. Ce poste s’adresse à une personne rigoureuse, polyvalente et motivée par les défis scientifiques liés au traitement et à la valorisation de données massives. Le goût pour le travail en équipe, l’autonomie et la curiosité scientifique seront déterminants.
Les compétences requises
_Savoir-faire (compétences techniques) : _
Solide maîtrise du développement web,
Frontend : JavaScript, HTML5 et CSS3, expérience avec des bibliothèques ou frameworks de visualisation de données (ex. : D3.js, Plotly, Chart.js…).
Backend : Node.js, PHP, Python, Connaissance des APIs REST, des protocoles HTTP, et des standards du web.
Bonnes connaissances des bases de données relationnelles (MySQL, PostgreSQL), et NoSQL (MongoDB).
Maîtrise des formats d’échange de données : JSON, XML.
Pratique du développement collaboratif : gestion de versions (Git), documentation, revue de code.
Capacité à concevoir des interfaces ergonomiques et performantes adaptées aux besoins de la communauté scientifique.
_Savoir-être (compétences relationnelles et personnelles) : _
Autonomie dans l’organisation du travail, sens de l’initiative.
Rigueur dans le développement et la documentation du code.
Esprit d’équipe, capacité à travailler en interaction avec des chercheurs, bioinformaticiens et ingénieurs.
Curiosité scientifique, goût pour l’apprentissage de nouveaux domaines (génomique, bioinformatique, biodiversité…).
Aisance en communication écrite et orale en français ; compréhension de l’anglais technique (lecture de documentation, échanges scientifiques).
Localisation du poste
Europe, France, Occitanie, Hérault (34)
Montpellier, CIRAD Lavalette.