Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

Virus viromics bioinformatique pipeline bacteriophages computer science genomics

Description

Explorer le “dark virome” (virome non caractérisé) par la bioinformatique : Développer un outil pour la découverte de virus bénéfiques pour la phytoprotection, la sécurité alimentaire et les alternatives aux antibiotiques.
Nous recherchons un(e) étudiant(e) en bioinformatique (MSc ou PhD) pour développer un pipeline bioinformatique dédié à la découverte de bactériophages bénéfiques à partir de données de métagénomique des sols. Le projet vise à accélérer l’identification de virus à fort potentiel en phytoprotection, sécurité alimentaire et alternatives aux antibiotiques, en combinant analyses computationnelles avancées et validations expérimentales. L’étudiant(e) travaillera dans un environnement multidisciplinaire au gouvernement du Canada, à l’Université du Québec à Montréal et à l’Université de Sherbrooke, avec accès à des jeux de données uniques et à des collaborations nationales et internationales.
La personne retenue devra s’inscrire à un programme de maîtrise ou de doctorat à l’Université du Québec à Montréal (UQAM) et devra maîtriser le français ou l’anglais, sans obligation d’être bilingue.

Exploring the “dark virome” (uncharacterized virome) through bioinformatics: developing tools to discover beneficial viruses for crop protection, food safety, and alternatives to antibiotics
MSc / PhD Position – Bioinformatics & Virome
We are seeking a highly motivated MSc or PhD student in bioinformatics to develop an innovative bioinformatics pipeline for the discovery of beneficial bacteriophages from soil metagenomic data. The project aims to accelerate the identification of viruses with applications in crop protection, food safety, and alternatives to antibiotics, through an integrated dry-lab/wet-lab approach. The student will join a multidisciplinary research environment at government of Canada, Université du Québec à Montréal and Université de Sherbrooke, and work with unique datasets and national and international collaborators.
The selected candidate will be required to enroll in a Master’s or PhD program at the Université du Québec à Montréal (UQAM) and must be proficient in either French or English; bilingualism is not required