Mots-Clés
Génétique
Neurodevelopment
Big data
Psychiatrie
WES
WGS
Description
Description du poste :
Sous la responsabilité du directeur du Dr S. Jacquemont, le bioinformaticien/data-manager devra identifier, annoter et analyser des variants génétique à partir de données de génotypage et de séquençage (exome et génome complet). Le projet explore l’impact de variants génétiques sur la cognition, le comportement et les traits psychiatriques et neurodéveloppementaux.
Le candidat sera responsable de
▪ Identification, annotation, analyse de variants génomiques structurels. Les data à analyser comprennent des données de génotypage sur 800000 individus et des données de séquençage (exome et génome complet) sur environ 150 000 individus;
▪ Gestion et coordination du travail en bio-informatique du laboratoire;
▪ Développement et rédaction des procédures de traitement des données dans le laboratoire;
▪ Organisation et hiérarchisation des données sur les serveurs (Compute Canada);
▪ Concevoir, optimiser et automatiser des pipelines d’analyse sur des infrastructures locales et cloud (AWS, Google Cloud);
▪ Documentation et communication sur le processus d’analyse, résultats, outils et techniques utilisés ;
▪ Interaction avec les membres du laboratoire afin d’élaborer des stratégies d’analyses.
Exigences et aptitudes :
▪ Niveau d’études : Maitrise ou PhD en bioinformatique, en génomique;
▪ Expérience en code sur un des langages suivants : Bash, Python, R, Hail, Spark, etc. ;
▪ Connaissance des infrastructures cloud (AWS, Google Cloud);
▪ Capacité de travailler en groupe sur plusieurs projets;
▪ Excellente maîtrise du français et de l’anglais, à l’oral comme à l’écrit;
▪ Bonne compétence en « Data management ».
Conditions d’emploi
Syndicat des employés du Centre de recherche du CHU Sainte-Justine (SECR)
Échelle salariale: Niveau 3 - entre 29.39 $ et 43.64 $ /heure (selon l’expérience de travail)
Chercheur responsable: Dr Sébastien Jacquemont
Poste : Régulier à temps complet (35 heures par semaine)
Date prévue d’entrée en fonction : Dès que possible
Autre : Le candidat sera également appelé à se déplacer, en fonction des besoins au Centre d’Innovation de GQ/McGill.
Avis important
Nous tenons à préciser que les candidats étrangers devront avoir un permis de travail valide pour le CHU Sainte-Justine. Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : « Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants, à l’enseignement au primaire ou au secondaire, au domaine de la santé ».
Veuillez utiliser notre site de recrutement pour postulez en ligne : http://www.chusj.org/fr/Emplois-benevolat/Emplois-disponibles. Seuls les candidats retenus seront contactés