Mots-Clés
scRNA-seq
cytométrie de masse
Olink
statistiques appliquées
Description
La Plateforme Immunomonitoring du Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille recrute un·e ingénieur·e en bioinformatique pour un projet ambitieux de recherche de biomarqueurs immunitaires à fort impact clinique, prédictifs de la réponse aux immunothérapies et de la toxicité immuno-induite.
Missions
• Développer et implémenter des outils d’analyse single-cell adaptés aux projets de la plateforme
• Analyser des données scRNA-seq, cytométrie de masse et Olink issues de cohortes cliniques
• Participer à la valorisation scientifique et au transfert de compétences
Profil recherché
• Bac+5 en bioinformatique / statistiques
• Expérience en analyses single-cell haute dimension (pré-traitements, QC, intégration, réduction de dimension, clustering, annotation…)
• Solides bases en statistiques appliquées (modèles linéaires/GLM, tests et corrections multiples, validation)
• Maîtrise de R / Python (Seurat, Scanpy ou équivalents)
• Pratique de la documentation reproductible (Quarto, R Markdown, Jupyter)
• Goût pour le travail en équipe et les échanges avec les expérimentateurs
• Des bases en immunologie sont un plus
Localisation
Plateforme Immunomonitoring – Institut Paoli Calmettes – Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille
Démarrage en Avril 2026
CDD de 10 à 15 mois