Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

bioinformatique structurale amarrage moléculaire minimisation d'énergie dynamique moléculaire biofilm prgrammation

Description

Dans le cadre d’un projet financé par l’ANR (Programme BIOScreenTarget), nous recrutons un(e) ingénieur(e) d’étude (IgE) à l’Université de Reims Champagne-Ardenne. Ce projet de recherche ANR transversal rassemble plusieurs unités de recherche : EA URCA 4961 (Biomatériaux et inflammation en site osseux) – UR Caen Normandie 4312 (Communication Bactérienne et Stratégies Anti-Infectieuses) – UMR CNRS/URCA 7312 (institut de Chimie Moléculaire) - UMR CNRS/URCA 7369 (Matrice extracellulaire et Dynamique Cellulaire). Le/la candidate sera rattaché(e) à la responsable du projet de l’Unité MEDyC (UFR Sciences Exactes et Naturelles, Campus Moulin de la Housse).
L’IgE travaillera sur l’identification in silico de cibles et de molécules antibiofilms. A partir des données obtenues par les collègues expérimentateurs, il/elle constituera des bases de données de ligands et de récepteurs, qui seront ensuite utilisées dans le cadre d’un criblage in silico à haut débit, réalisé à l’aide de l’approche AMIDE version 2, développée à Reims. Les données générées seront ensuite analysées afin d’identifier les complexes ligand/récepteur les plus prometteurs, ainsi que les principaux mécanismes d’interaction mis en jeu entre les molécules. La stabilité de ces complexes en environnement biologique pourra être évaluée par des simulations de dynamique moléculaire.