Mots-Clés
Diversité
Variations structurales
génomique
biostatistiques
génétique quantitative
plantes
Description
Profil n°260139
Description profil Enseignement : Enseignements de biologie végétale en Licence Sciences de la vie / Master Sciences du vivant La ou le Maître de Conférences recruté.e assurera son service d’enseignement au sein de la Faculté des Sciences de la Vie de l’Université de Strasbourg. Elle ou il contribuera aux enseignements de biologie végétale en Licence et en Master, notamment dans les parcours « Plantes, Biologie Moléculaire et Biotechnologies », « Plantes, Molécules Bioactives et Valorisation » et « Plantes, Environnement et Génie Écologique ». La ou le Maître de Conférences recruté.e disposera d’une expertise, attestée par une expérience de recherche, dans le domaine de la génomique et de la génétique quantitative végétales, ainsi que de compétences solides en biostatistique, tant sur les plans théorique que méthodologique. En Master, elle ou il interviendra principalement dans les enseignements de M1 communs aux trois parcours précités, consacrés aux outils fondamentaux de la statistique appliquée à la biologie, avec pour objectif de former les étudiant.e.s à une utilisation rigoureuse et pertinente des méthodes biostatistiques et des outils de visualisation de données biologiques. Elle ou il interviendra également en génomique et génétique végétales dans l’UE « Amélioration génétique des plantes », en lien étroit avec les activités de recherche. Elle ou il s’impliquera par ailleurs dans les activités de l’équipe pédagogique, notamment l’encadrement des projets Végé-LAB (UE de Master « Démarche scientifique et gestion de projet ») et l’évaluation des travaux de fin d’études. Une part importante de l’activité d’enseignement sera consacrée aux travaux pratiques en L1 et L2, en biologie et physiologie végétales. La personne recrutée participera en particulier aux enseignements de travaux pratiques dans les UE « Diversité et fonctionnement des angiospermes » et « Plantes, évolution et adaptations physiologiques ». Elle ou il contribuera également aux UE transversales de Licence, telles que « Méthodologie du travail universitaire et démarche scientifique » et/ou « Accompagnement du projet étudiant », visant à fournir aux étudiant.e.s des outils méthodologiques adaptés aux exigences universitaires, à favoriser leur autonomie et à développer une démarche scientifique rigoureuse et critique. Langue d’enseignement : Les enseignements sont dispensés en français. La personne recrutée pourra, si elle le souhaite, assurer des enseignements en anglais au sein d’UE de master. Nom & coordonnées de la personne à contacter pour tout renseignement complémentaire : Emmanuel GAQUEREL : egaquerel@unistra.fr, 03 67 15 53 52
Description profil Recherche : Génomique structurale et évolutive pour la création des vignes du futur L’UMR Université de Strasbourg-INRAE Santé de la Vigne et Qualité du Vin (SVQV) à Colmar est à la pointe des recherches pour répondre à la demande sociétale d’une agriculture plus respectueuse de l’environnement. Un aboutissement récent de l’unité a été l’obtention de 12 nouvelles variétés de vigne permettant une réduction de 90% des traitements fongicides. Pour alimenter les programmes de création des vignes du futur, l’UMR SVQV poursuit des travaux sur le déterminisme génétique des résistances aux maladies, des caractéristiques agronomiques mais aussi de la qualité organoleptique des raisins et des vins et combine des compétences et des ressources en génomique, transcriptomique, génétique, métabolomique et phénomique à haut débit. Le projet de recherche de la ou du Maître de Conférences recruté.e sera centré sur la génomique structurale et évolutive chez la vigne et plus précisément sur la caractérisation des structures et des variations génomiques des haplotypes des variétés et espèces utilisées, leur origine évolutive, et les conséquences sur les recombinaisons possibles dans leurs descendances. L’analyse de l’impact sur le phénotype de ces variations génomiques, de l’expression des gènes impliqués et de leur régulation épigénétique, sera utilisée pour comprendre les déterminants biologiques des caractères d’intérêt. Elle ou il intègrera le groupe de Camille Rustenholz (DR2 INRAE) à l’interface entre les équipes « Génomique et Métabolisme de la Vigne » et « Génétique et Amélioration de la Vigne » qui sont internationalement reconnus pour leur expertise en génomique de la vigne et dans le développement de méthodes de création variétale innovantes. Les compétences en bioinformatique, en biostatistique et la maîtrise des concepts de l’intelligence artificielle permettront au Maître de Conférences recruté.e de développer des méthodes pour intégrer les données de génomique (>30 assemblages diploïdes de génomes, >4000 séquences de génomes complets, >2000 génotypes caractérisés par “Genotyping-By-Sequencing”, >4000 jeux de données RNA-Seq) aux données de phénotypage (LiDAR, imagerie RVB et multispectrale) et de profilage métabolique (UHPLC-MS, GC-MS). Pour ce faire, elle ou il aura accès au serveur de calculs de l’UMR (162 CPU et 1,5To de RAM) et aux infrastructures informatiques de l’Université et d’INRAE. Nom & coordonnées de la personne à contacter pour tout renseignement complémentaire : Camille RUSTENHOLZ : camille.rustenholz@inrae.fr, 03 89 22 49 81
Candidature via Odyssée jusqu’au 2 avril 2026 à 16h