Mots-Clés
NGS
Bio-informaticien
Description
MISSION
L’Institut de Cancérologie de l’Ouest (ICO) est un Centre de Lutte contre le Cancer, établissement de santé privé d’intérêt
collectif qui a une quadruple vocation : la Prévention, le Soin, la Recherche et l’Enseignement.
Dans le cadre des activités de la Plateforme de Génétique moléculaire du Département de Biologie Médicale et Biologie
des essais cliniques sur le site angevin, l’ICO recherche un bio-informaticien expérimenté (équipe de 3 bio-informaticiens
sur cette plateforme). Le bio-informaticien est chargé de la mise en place, du maintien et de l’amélioration des workflows
d’analyse bioinformatique provenant des séquenceurs à haut débit (NGS) à visée diagnostique et recherche, et de l’analyse
des données de génomique (panels ciblés, WES, WGS, WTS). Il participe à l’accréditation ISO15189 des applications
bioinformatiques.
ACTIVITES
Bioinformatique
• Mise en place, supervision et exécution des workflows d’analyses bioinformatiques basés sur les technologies de
biologie moléculaire et de NGS.
• Analyse des données de génomique constitutionnelle et somatique produites sur la plateforme de l’ICO : panels ciblés
(ADN et ARN), exome (WES), génome (WGS), transcriptome (WTS), signatures mutationnelles, CNV…
• Mise en forme des résultats (visualisation des données).
• Formation des utilisateurs finaux.
• Participation aux évolutions techniques et applicatives des workflows mis en place, veille scientifique
Qualité
• Mise en place et maintien de l’accréditation ISO15189 du NGS pour la composante informatique en relation avec le
responsable de l’accréditation.
• Participation au système de management de la qualité via l’extraction de données du logiciel de gestion de
laboratoire (activité, facturation, délais, non-conformités …).
Projets
• Participation aux projets transversaux.
Autres
• Participation à la valorisation scientifique.
• Participation à l’encadrement de stagiaires (M1, M2).
PROFIL
• Diplôme : Bio-informaticien (BAC +5)
• Double formation universitaire souhaitée : Biologie (biologie moléculaire et génomique) et Informatique (langages :
Python, R, HTML, SQL … ; environnement : Unix)
• Connaissance souhaitée de la norme ISO15189 et de la démarche qualité au sein d’un établissement de santé.
CONTRAT – STATUT
• Poste à pourvoir sur le site d’Angers dès que possible
• CDI temps plein
• Statut Cadre (convention collective des Centres de Lutte Contre le Cancer)