Mots-Clés
single-cell
spatial transcriptomics
pediatric cancer
brain development
Description
Laboratoires
Le laboratoire Génomique et Développement des Cancers de l’Enfant (https://institut-curie.org/team/saulnier), dirigé par le Dr Olivier Saulnier recherche un ingénieur en bioinformatique sur la génomique des cancers / des cellules uniques. Nous sommes situés au cœur de Paris à l’Institut Curie, l’une des principales institutions mondiales de recherche sur le cancer. Cela représente un environnement excellent et international avec une expertise interdisciplinaire et des plateformes technologiques de haute qualité.
Missions
Notre laboratoire vise à mieux comprendre les origines développementales des cancers cérébraux pédiatriques. Le projet impliquera une caractérisation multi-omique de tissus fœtaux humains et de tumeurs cérébrales pédiatriques en utilisant des approches de transcriptomique unicellulaire, spatiale et métabolomique.
Publications clés
1/ Saulnier, Zagozewski, Liang, Hendrikse, et al., A Group 3 medulloblastoma stem cell program is maintained by OTX2-mediated alternative splicing. Nature Cell Biology. 2024
2/ Visvanathan, Saulnier, Chuan, et al., Early Rhombic Lip Protogenin+ve Stem Cells in a Human Specific Neurovascular Niche Initiate and Maintain Group 3 Medulloblastoma. Cell 2024
3/ Hendrikse, Haldipur, Saulnier, et al., Failure of human rhombic lip differentiation underlies medulloblastoma formation. Nature. 2022
Profil recherché
Formation et expérience requises
- Formation : Le/la candidat(e) devra être titulaire, ou en cours d’obtention, d’un diplôme de Master ou d’ingénieur en bioinformatique ou dans un domaine proche.
- Compétences scientifiques : Le/la candidat(e) devra posséder de solides compétences en analyse computationnelle, ainsi qu’un fort intérêt pour la biologie du cancer, la génomique et/ou la biologie du développement.
- Expérience professionnelle requise : Une expérience en NGS, single-cell et en omiques spatiales.
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Compétences requises
- Compétences linguistiques : Très bon niveau d’anglais et compétences en communication.
- Capacité à travailler de manière autonome, à communiquer et à travailler en équipe.
- Le candidat doit être très motivé, curieux et enthousiaste à l’idée de travailler en équipe collaborative.
Toutes nos opportunités sont ouvertes aux personnes en situation de handicap.
Information sur le contrat
Type de contrat : Contrat à durée déterminée
Date de début : Dès que possible
Durée : 2 ans (renouvelable)
Temps de travail : Temps plein
Rémunération : Selon les grilles en vigueur
Avantages : Restauration collective, remboursement des frais de transport jusqu’à 70 %, assurance maladie complémentaire
Lieu du poste : Paris
Contact
Veuillez envoyer un CV, une lettre de motivation ainsi que les coordonnées d’au moins deux références à olivier.saulnier@curie.fr.
Les candidatures seront examinées dès réception.