Mots-Clés
metabarcoding
virus
plancton
Description
Dans le cadre du PIA AO-EMBRC et de l’ANR BONUS ; la plateforme ABiMS de bioinformatique et de gestion de données marines de la station biologique de Roscoff recrute un(e) Analyste de données de biodiversité moléculaire marine (H/F). L’ingénieur(e) sera responsable de l’analyse et de l’intégration de données de metabarcoding.
Le projet « Observatoires Augmentés du Centre National de Ressources Biologiques Marines (EMBRC-France) », AO-EMBRC, vise à soutenir et développer des observatoires augmentés de biologie marine en France, afin de mener des études de suivi temporel des communautés d’organismes marins sur plusieurs sites des côtes métropolitaines.
Dans ce contexte, l’ingénieur(e) recruté(e) sera en charge de l’intégration, du traitement et d’une partie de l’analyse des données de biodiversité moléculaire (metabarcoding) depuis leur collecte sur les sites étudiés jusqu’à leur mise à disposition au sein de la communauté scientifique partenaire du projet puis leur diffusion à l’ensemble de la communauté scientifique au travers des entrepôts de données existants.
Dans le contexte du projet ANR BONUS (porté par Anne Claire Baudoux, UMR 7144), un suivi temporel de diversité moléculaire de virus de microalgues dominantes (diatomées) sera plus spécifiquement étudiée par des approches innovantes dans des échantillons d’eau de mer prélevés au large de Roscoff.
L’ingénieur(e) sera localisé(e) à la Station Biologique de Roscoff, au sein de la plateforme ABiMS, avec de fortes interactions avec les équipes de recherche de la station, les autres stations de biologie marine (Banyuls-sur-mer et Villefranche-sur-mer) ainsi qu’avec le CEA / Genoscope à Evry.
L’ingénieur(e) sera sous la responsabilité de technique de l’ingénieur en charge du traitement des données de diversité au sein de l’équipe, et sous l’autorité hiérarchique du responsable de service.
À l’issue de ce contrat, une poursuite jusqu’à fin décembre 2027 est programmée dans le cadre d’un second contrat Sorbonne Université de 15 à 16 mois.